Introducción a la Inferencia Bayesiana para la Salud Pública en Python
VolverInformación General
Programa | XXVI Escuela Internacional de Verano 2025 |
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Año | 2025 |
Semestre | Primero |
Nombre | Introducción a la Inferencia Bayesiana para la Salud Pública en Python |
Nombre Convenio Marco | |
Equipo coordinador | Encargado: Rodrigo Villegas Ríos Coordinador: Rodrigo Villegas Ríos Administrativo: Priscilla Pino Tolosa |
Equipo docente |
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Académicos Externos |
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Unidad académica | Programa de Bioestadística |
Versión | 1 |
Modalidad | Híbrida (presencial/on line) |
Tipo de Curso | Postgrado |
Créditos 30 | 0 |
Horas del Programa |
Horas directas (sincrónicas y asincrónicas): 20 Horas indirectas: 10 |
Días y Horarios | Lunes a viernes 14:00 a 18:00 horas. |
Lugar | |
Cupo alumnos mínimo | 0 |
Cupo alumnos máximo | 0 |
Competencias y Habilidades necesarias para la Asignatura (Pre-requisitos) |
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Arancel | $ |
Duración (semanas) | 1 |
Fecha Inicio | 13/01/2025 |
Fecha Término | 17/01/2025 |
Características del Curso
Área Temática
Fundamentos
La flexibilidad en el diseño y creación de modelos estadísticos es fundamental para el análisis de datos científicos. PyMC es un software de estadística Bayesiana basado en Python que permite la implementación de modelos estadísticos programándolos desde su estructura base. PyMC provee docenas de distribuciones estadísticas y funciones matemáticas, además de protocolos de tensorización (vía pytensor), diferentes tipos de muestreos (e.g. MCMC), entre otras funciones. De este modo, PyMC puede usarse como una herramienta eficaz para resolver todo tipo de problemas estadísticos en salud pública, desde procesos de Poisson hasta modelos de ecuaciones diferenciales.
Objetivo General
Entregar los conocimientos básicos para diseñar y muestrear modelos bioestadísticos en PyMC, desde la estructura matemática del modelo hasta resultados y gráficas
Objetivos Específicos
- Procesamiento de datos, workflow Bayesiano: diseño de estructura de modelos, prior predictive checks, sampleo con Hamiltonian Montecarlo (HMC), interpretación de distribuciones posteriores, posterior predictive checks.
- Reporte de resultados a través de tablas y gráficos
Contenidos/Temas
Se mostrará el uso de PyMC y se aplicará a problemas específicos en salud pública. Se aplicará el proceso en un workflow Bayesiano para obtener inferencia científica interpretable de los resultados.
Destinatarios
Estudiantes, profesores y profesionales del ámbito de las ciencias biomédicas interesados en el aprendizaje del software PyMC para realizar la gestión y el análisis de sus datos.
Metodología
Clases expositivas teórica .
Realización de ejercicios prácticos con apoyo de material didáctico y asistencia docente. Realización de ejemplos prácticos para su desarrollo en horas fuera de clases.
Material audiovisual/escrito de apoyo al aprendizaje.
Formas de Evaluación
- Este curso es evaluado
Calendario
Sesión | Fecha | Hora | Docentes | Contenidos | Modalidad | Actividad |
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13 enero 2025 | 14:00 - 18:00 | Simón Busch-Moreno | Introducción a PyMC. Ejemplo con datos espaciales/temporaLES | Presencial | Clase | |
14 enero 2025 | 14:00 - 18:00 | Simón Busch-Moreno | Estructura matemática del modelo y uso apropiado de distribuciones | Presencial | Clase | |
15 enero 2025 | 14:00 - 18:00 | Simón Busch-Moreno | Selección y chequeo de priors | Presencial | Clase | |
16 enero 2025 | 14:00 - 18:00 | Simón Busch-Moreno | Sampleo del modelo HMC y evaluación de la convergencia | Presencial | Clase | |
17 enero 2025 | 14:00 - 18:00 | Simón Busch-Moreno | Evaluación de distribuciones posteriores y presentación de resultados | Presencial | Clase |
Bibliografía
Tipo lectura | Tipo contenido | Referencia | Archivos |
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Básica/Obligatoria | Libro | Martin Osvaldo A, Kumar Ravin; Lao Junpeng Bayesian Modeling and Computation in Python Boca Ratón, 2021. ISBN 978-0-367-89436-8 |
Recursos de Plataforma
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