Introducción a la Inferencia Bayesiana para la Salud Pública en Python

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Información General

Programa XXVI Escuela Internacional de Verano 2025
Año 2025
Semestre Primero
Nombre Introducción a la Inferencia Bayesiana para la Salud Pública en Python
Nombre Convenio Marco
Equipo coordinador Encargado: Rodrigo Villegas Ríos
Coordinador: Rodrigo Villegas Ríos
Administrativo: Catherine Sanhueza Cordero

Equipo docente
Académicos Externos
  • Simón Busch-Moreno - Universidad de Oxford
Unidad académica Programa de Bioestadística
Versión 1
Modalidad Híbrida (presencial/on line)
Tipo de Curso Postgrado
Créditos 30 0
Horas del Programa Horas directas (sincrónicas y asincrónicas): 20
Horas indirectas: 10
Días y Horarios Lunes a viernes 14:00 a 18:00 horas.
Lugar
Cupo alumnos mínimo 10
Cupo alumnos máximo 20
Competencias y Habilidades
necesarias para la Asignatura (Pre-requisitos)

Conocimientos básicos de Estadística Bayesiana.

Uso del lenguaje Python

Arancel $
Duración (semanas) 1
Fecha Inicio 13/01/2025
Fecha Término 17/01/2025

Características del Curso

Área Temática

Ciencia de datos y modelamiento en salud pública

Fundamentos

La flexibilidad en el diseño y creación de modelos estadísticos es fundamental para el análisis de datos científicos. PyMC es un software de estadística Bayesiana basado en Python que permite la implementación de modelos estadísticos programándolos desde su estructura base. PyMC provee docenas de distribuciones estadísticas y funciones matemáticas, además de protocolos de tensorización (vía pytensor), diferentes tipos de muestreos (e.g. MCMC), entre otras funciones. De este modo, PyMC puede usarse como una herramienta eficaz para resolver todo tipo de problemas estadísticos en salud pública, desde procesos de Poisson hasta modelos de ecuaciones diferenciales.

Objetivo General

Entregar los conocimientos básicos para diseñar y muestrear modelos bioestadísticos en PyMC, desde la estructura matemática del modelo hasta resultados y gráficas

Objetivos Específicos

  • Procesamiento de datos, workflow Bayesiano: diseño de estructura de modelos, prior predictive checks, sampleo con Hamiltonian Montecarlo (HMC), interpretación de distribuciones posteriores, posterior predictive checks.
  • Reporte de resultados a través de tablas y gráficos

Contenidos/Temas

Se mostrará el uso de PyMC y se aplicará a problemas específicos en salud pública. Se aplicará el proceso en un workflow Bayesiano para obtener inferencia científica interpretable de los resultados.

Destinatarios

Estudiantes, profesores y profesionales del ámbito de las ciencias biomédicas interesados en el aprendizaje del software PyMC para realizar la gestión y el análisis de sus datos.

Metodología

Clases expositivas teórica .

Realización de ejercicios prácticos con apoyo de material didáctico y asistencia docente. Realización de ejemplos prácticos para su desarrollo en horas fuera de clases.

Material audiovisual/escrito de apoyo al aprendizaje.

Formas de Evaluación

  • Este curso es evaluado

Calendario

Sesión Fecha Hora Docentes Contenidos Modalidad Actividad
13 enero 2025 14:00 - 18:00 Simón Busch-Moreno Introducción a PyMC. Ejemplo con datos espaciales/temporaLES Presencial Clase
14 enero 2025 14:00 - 18:00 Simón Busch-Moreno Estructura matemática del modelo y uso apropiado de distribuciones Presencial Clase
15 enero 2025 14:00 - 18:00 Simón Busch-Moreno Selección y chequeo de priors Presencial Clase
16 enero 2025 14:00 - 18:00 Simón Busch-Moreno Sampleo del modelo HMC y evaluación de la convergencia Presencial Clase
17 enero 2025 14:00 - 18:00 Simón Busch-Moreno Evaluación de distribuciones posteriores y presentación de resultados Presencial Clase

Bibliografía

Tipo lectura Tipo contenido Referencia Archivos
Básica/Obligatoria Libro Martin Osvaldo A, Kumar Ravin; Lao Junpeng Bayesian Modeling and Computation in Python Boca Ratón, 2021. ISBN 978-0-367-89436-8

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